雙峰駝TPM2與TPM3基因表達模式及其功能探究
發(fā)布時間:2020-12-09 03:14
雙峰駝作為一種古老而獨特的動物,有著不可估量的研究價值。雙峰駝屬于典型的精清誘導排卵型動物,有明顯的季節(jié)性發(fā)情特征。在繁殖季節(jié)與非繁殖季節(jié)不同的生活習性使的雙峰駝生殖生理存在一定差異。基于本研究團隊前期利用蛋白組學技術,發(fā)現(xiàn)肌肉生長發(fā)育相關差異原肌球蛋白2(TPM2)與原肌球蛋白3(TPM3)。原肌球蛋白2和原肌球蛋白3結構功能既有相似性也有特異性,編碼平滑肌、骨骼肌等肌肉異構體的同時,也編碼肌肉成纖維細胞異構體,對細胞產生不同的影響。為了進一步揭示TPM2基因和TPM3基因在不同繁殖期雙峰駝肌肉中的作用,本研究以繁殖季節(jié)雙峰母駝為研究對象,通過RT-PCR技術克隆雙峰駝TPM2和TPM3基因并進行序列,分析TPM2基因和TPM3基因基本功能;應用免疫熒光技術、免疫組織化學法、qRT-PCR、Western blot法驗證TPM2基因和TPM3基因在繁殖季節(jié)雙峰母駝肌肉具體表達情況,探究TPM2基因和TPM3基因在繁殖與非繁殖季節(jié)雙峰母駝肌肉組織中的表達模式;以雙峰駝肌纖維細胞為基礎,通過轉染siRNA的方法,探索干擾序列對肌纖維細胞凋亡的影響。結果發(fā)現(xiàn):1.克隆得到雙峰駝CDS全長為...
【文章來源】:甘肅農業(yè)大學甘肅省
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
Bcl-2家族成員間異型和同型二聚體結合調控細胞凋亡的原理圖
雙峰駝TPM2與TPM3基因表達模式及其功能探究13圖2-1雙峰駝TPM2和TPM3基因PCR擴增產物瓊脂糖凝膠電泳圖Fig2-1BactriancamelTPM2andTPM3genePCRamplificationproductagarosegelelectrophoresis2.2雙峰駝TPM2、TPM3基因核苷酸及氨基酸序列分析根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫中的ORFFinder軟件分析雙峰駝TPM2基因序列,開放閱讀框根據(jù)序列比對分析雙峰駝TPM2基因的序列,起始密碼子ATG位在109bp處,終止密碼子TAG位于963bp處。應用ProtParam軟件預測TPM2理化性質,分子式為C1400H2325N397O498S115,分子量為33.03988KD,理論等電點為(pI)4.65。而TPM3基因序列比對結果顯示起始密碼子ATG位在146bp處,終止密碼子TAG位于521bp處,預測TPM3理化性質結果顯示,分子式為C927H1588N294O311S5,分子量為21.98889KD,理論等電點為(pI)5.40,兩蛋白都屬于酸性蛋白。TMHMM2.0Server程序進行跨膜區(qū)預測,表明TPM2、TPM3蛋白都不存在跨膜區(qū)域。亞細胞定位分析雙峰駝TPM2、TPM3蛋白定位于細胞核,在線粒體、細胞質、細胞骨架、細胞膜以及胞質中均有分布,主要在細胞核中大量分布。圖2-2雙峰駝TPM2二級結構預測Fig2-2PredictionofsecondarystructureofBactriancamelTPM2
雙峰駝TPM2與TPM3基因表達模式及其功能探究13圖2-1雙峰駝TPM2和TPM3基因PCR擴增產物瓊脂糖凝膠電泳圖Fig2-1BactriancamelTPM2andTPM3genePCRamplificationproductagarosegelelectrophoresis2.2雙峰駝TPM2、TPM3基因核苷酸及氨基酸序列分析根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫中的ORFFinder軟件分析雙峰駝TPM2基因序列,開放閱讀框根據(jù)序列比對分析雙峰駝TPM2基因的序列,起始密碼子ATG位在109bp處,終止密碼子TAG位于963bp處。應用ProtParam軟件預測TPM2理化性質,分子式為C1400H2325N397O498S115,分子量為33.03988KD,理論等電點為(pI)4.65。而TPM3基因序列比對結果顯示起始密碼子ATG位在146bp處,終止密碼子TAG位于521bp處,預測TPM3理化性質結果顯示,分子式為C927H1588N294O311S5,分子量為21.98889KD,理論等電點為(pI)5.40,兩蛋白都屬于酸性蛋白。TMHMM2.0Server程序進行跨膜區(qū)預測,表明TPM2、TPM3蛋白都不存在跨膜區(qū)域。亞細胞定位分析雙峰駝TPM2、TPM3蛋白定位于細胞核,在線粒體、細胞質、細胞骨架、細胞膜以及胞質中均有分布,主要在細胞核中大量分布。圖2-2雙峰駝TPM2二級結構預測Fig2-2PredictionofsecondarystructureofBactriancamelTPM2
【參考文獻】:
期刊論文
[1]貴州黑山羊快肌肌鈣蛋白基因克隆和氨基酸序列分析[J]. 陳浩林,吳仙,朱冠群,毛鳳顯,陳燕,鄧大鵬. 貴州畜牧獸醫(yī). 2018(06)
[2]微小RNA-193a通過原肌球蛋白調控對人肺癌細胞株A549的侵襲和增殖的影響[J]. 張春敭,齊宇,吳愷,張巖,趙松. 中華實驗外科雜志. 2018 (03)
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博士論文
[1]Sonic hedgehog信號通路對正常角質形成細胞增殖及凋亡的影響及其分子機制[D]. 劉海燕.第四軍醫(yī)大學 2015
[2]TPM4在結直腸癌中的表達及其生物學意義[D]. 趙月鳴.吉林大學 2015
[3]狹鱈和牛肌肉組織提取物在牛肉嫩化中的作用機理研究[D]. 王蓉蓉.南京農業(yè)大學 2012
[4]GLP-1對骨骼肌肌球蛋白重鏈表達的影響及機制研究[D]. 王麗娜.南京農業(yè)大學 2009
[5]雜種大白×梅山F1代與其母本梅山豬背最長肌間差異表達基因的克隆鑒定及其特征分析[D]. 黃濤.華中農業(yè)大學 2006
碩士論文
[1]應用siRNA敲低TPM3基因表達后對大鼠胰腺癌細胞生物學行為的影響[D]. 馬翔.蚌埠醫(yī)學院 2013
[2]利用表達譜芯片技術篩選家兔肌肉發(fā)育相關基因[D]. 李挺.揚州大學 2013
[3]組織間隙液中肝細胞癌診斷候選標志物的發(fā)現(xiàn)[D]. 劉志磊.安徽醫(yī)科大學 2012
[4]Bcl-2抑制劑的合成與抗腫瘤細胞活性篩選及抗結核菌核苷類化合物的合成[D]. 李靜.蘇州大學 2010
[5]閹牛、公牛背最長肌消減cDNA文庫的構建和差異表達基因的篩選與鑒定[D]. 周正奎.中國農業(yè)科學院 2008
[6]姜曲海母豬初情期前卵巢和子宮腺體發(fā)育和激素水平的研究[D]. 劉春玲.揚州大學 2004
本文編號:2906159
【文章來源】:甘肅農業(yè)大學甘肅省
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
Bcl-2家族成員間異型和同型二聚體結合調控細胞凋亡的原理圖
雙峰駝TPM2與TPM3基因表達模式及其功能探究13圖2-1雙峰駝TPM2和TPM3基因PCR擴增產物瓊脂糖凝膠電泳圖Fig2-1BactriancamelTPM2andTPM3genePCRamplificationproductagarosegelelectrophoresis2.2雙峰駝TPM2、TPM3基因核苷酸及氨基酸序列分析根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫中的ORFFinder軟件分析雙峰駝TPM2基因序列,開放閱讀框根據(jù)序列比對分析雙峰駝TPM2基因的序列,起始密碼子ATG位在109bp處,終止密碼子TAG位于963bp處。應用ProtParam軟件預測TPM2理化性質,分子式為C1400H2325N397O498S115,分子量為33.03988KD,理論等電點為(pI)4.65。而TPM3基因序列比對結果顯示起始密碼子ATG位在146bp處,終止密碼子TAG位于521bp處,預測TPM3理化性質結果顯示,分子式為C927H1588N294O311S5,分子量為21.98889KD,理論等電點為(pI)5.40,兩蛋白都屬于酸性蛋白。TMHMM2.0Server程序進行跨膜區(qū)預測,表明TPM2、TPM3蛋白都不存在跨膜區(qū)域。亞細胞定位分析雙峰駝TPM2、TPM3蛋白定位于細胞核,在線粒體、細胞質、細胞骨架、細胞膜以及胞質中均有分布,主要在細胞核中大量分布。圖2-2雙峰駝TPM2二級結構預測Fig2-2PredictionofsecondarystructureofBactriancamelTPM2
雙峰駝TPM2與TPM3基因表達模式及其功能探究13圖2-1雙峰駝TPM2和TPM3基因PCR擴增產物瓊脂糖凝膠電泳圖Fig2-1BactriancamelTPM2andTPM3genePCRamplificationproductagarosegelelectrophoresis2.2雙峰駝TPM2、TPM3基因核苷酸及氨基酸序列分析根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫中的ORFFinder軟件分析雙峰駝TPM2基因序列,開放閱讀框根據(jù)序列比對分析雙峰駝TPM2基因的序列,起始密碼子ATG位在109bp處,終止密碼子TAG位于963bp處。應用ProtParam軟件預測TPM2理化性質,分子式為C1400H2325N397O498S115,分子量為33.03988KD,理論等電點為(pI)4.65。而TPM3基因序列比對結果顯示起始密碼子ATG位在146bp處,終止密碼子TAG位于521bp處,預測TPM3理化性質結果顯示,分子式為C927H1588N294O311S5,分子量為21.98889KD,理論等電點為(pI)5.40,兩蛋白都屬于酸性蛋白。TMHMM2.0Server程序進行跨膜區(qū)預測,表明TPM2、TPM3蛋白都不存在跨膜區(qū)域。亞細胞定位分析雙峰駝TPM2、TPM3蛋白定位于細胞核,在線粒體、細胞質、細胞骨架、細胞膜以及胞質中均有分布,主要在細胞核中大量分布。圖2-2雙峰駝TPM2二級結構預測Fig2-2PredictionofsecondarystructureofBactriancamelTPM2
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[9]雄激素與女性生殖[J]. 崔毓桂,邵麗,千日成,劉嘉茵. 國際生殖健康/計劃生育雜志. 2014(05)
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[5]雜種大白×梅山F1代與其母本梅山豬背最長肌間差異表達基因的克隆鑒定及其特征分析[D]. 黃濤.華中農業(yè)大學 2006
碩士論文
[1]應用siRNA敲低TPM3基因表達后對大鼠胰腺癌細胞生物學行為的影響[D]. 馬翔.蚌埠醫(yī)學院 2013
[2]利用表達譜芯片技術篩選家兔肌肉發(fā)育相關基因[D]. 李挺.揚州大學 2013
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[4]Bcl-2抑制劑的合成與抗腫瘤細胞活性篩選及抗結核菌核苷類化合物的合成[D]. 李靜.蘇州大學 2010
[5]閹牛、公牛背最長肌消減cDNA文庫的構建和差異表達基因的篩選與鑒定[D]. 周正奎.中國農業(yè)科學院 2008
[6]姜曲海母豬初情期前卵巢和子宮腺體發(fā)育和激素水平的研究[D]. 劉春玲.揚州大學 2004
本文編號:2906159
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