發(fā)布時間：2020-12-15 08:29

　　棉花是全球性經(jīng)濟作物,更是我國重要的經(jīng)濟作物,主要用于生產天然纖維和棉籽油,是重要的紡織工業(yè)原料,又是鹽堿地先鋒作物,陸地棉（Gossypium hirsutum L.）是目前我國種植最為廣泛的棉種之一。由于糧棉爭地問題的激化,棉花的種植地域受到了嚴重的影響,逐漸的向偏遠的內陸高原以及鹽堿地遷移,對棉花的抗逆性提出了更高的要求。因此,對棉花的抗逆相關基因進行生物信息學鑒定和基因組學分析,對解析棉花抗逆機理和培育抗逆品種具有重要參考價值。本研究以陸地棉、亞洲棉和雷蒙德氏棉全基因組測序數(shù)據(jù)為基礎,通過生物信息學手段,對三個棉種堿性區(qū)亮氨酸拉鏈（basic region-leucine zipper,bZIP）轉錄因子基因家族進行了基因組學的鑒定及分析,為陸地棉bZIP基因的功能研究與利用提供參考。主要研究結果如下:1.在陸地棉基因組中鑒定出151個bZIP基因,亞洲棉基因組中鑒定出85個bZIP基因,雷蒙德氏棉基因組中鑒定出86個bZIP基因使用BioEdit軟件,以擬南芥（Arabidopsis thaliana）和水稻（Oryza sativa L.）的bZIP基因全長蛋白序列為查詢,... 

【文章來源】：山東農業(yè)大學山東省

【文章頁數(shù)】：76 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

環(huán)境脅迫誘導基因的轉錄表達示意圖（劉強等，2000）

山東農業(yè)大學碩士專業(yè)學位論文圖2擬南芥和陸地棉bZIP基因系統(tǒng)發(fā)育分析Fig.2PhylogeneticanalysisofbZIPgeneinG.hirsutumandArabidopsisthaliana19

棉花bZIP基因家族全基因組鑒定及分析圖3陸地棉、亞洲棉和雷蒙德氏棉bZIP基因系統(tǒng)發(fā)育分析Fig.3PhylogeneticanalysisofbZIPgeneinG.hirsutum、G.arboreumandG.raimondii3.4bZIP基因結構及蛋白保守基序分析對蛋白質保守基序和基因結構的分析是研究基因進化的重要方法，本研究分別使用GSDS和MEME對三個棉種bZIP基因的蛋白保守和結構進行分析。3.4.1陸地棉bZIP基因結構及蛋白保守基序分析如圖4B所示，陸地棉bZIP基因的長度、外顯子數(shù)量及外顯子長度變化范圍較大，其中有45個基因只有1個外顯子、無內含子，基因數(shù)量占陸地棉bZIP基因總數(shù)的29.8%，其中有44個基因都來自于S亞家族，1個基因Ghir_D06G003940來自于D亞家族。還有一個S亞家族的基因Ghir_A01G011110，含有1個外顯子和1個內含子。大多數(shù)陸地棉bZIP基因含有4-6個外顯子，數(shù)量占陸地棉bZIP基因總數(shù)的53.6%，而其中含有420


本文編號：2917981