發(fā)布時(shí)間：2020-12-15 08:29

　　棉花是全球性經(jīng)濟(jì)作物,更是我國(guó)重要的經(jīng)濟(jì)作物,主要用于生產(chǎn)天然纖維和棉籽油,是重要的紡織工業(yè)原料,又是鹽堿地先鋒作物,陸地棉（Gossypium hirsutum L.）是目前我國(guó)種植最為廣泛的棉種之一。由于糧棉爭(zhēng)地問題的激化,棉花的種植地域受到了嚴(yán)重的影響,逐漸的向偏遠(yuǎn)的內(nèi)陸高原以及鹽堿地遷移,對(duì)棉花的抗逆性提出了更高的要求。因此,對(duì)棉花的抗逆相關(guān)基因進(jìn)行生物信息學(xué)鑒定和基因組學(xué)分析,對(duì)解析棉花抗逆機(jī)理和培育抗逆品種具有重要參考價(jià)值。本研究以陸地棉、亞洲棉和雷蒙德氏棉全基因組測(cè)序數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),通過生物信息學(xué)手段,對(duì)三個(gè)棉種堿性區(qū)亮氨酸拉鏈（basic region-leucine zipper,bZIP）轉(zhuǎn)錄因子基因家族進(jìn)行了基因組學(xué)的鑒定及分析,為陸地棉bZIP基因的功能研究與利用提供參考。主要研究結(jié)果如下:1.在陸地棉基因組中鑒定出151個(gè)bZIP基因,亞洲棉基因組中鑒定出85個(gè)bZIP基因,雷蒙德氏棉基因組中鑒定出86個(gè)bZIP基因使用BioEdit軟件,以擬南芥（Arabidopsis thaliana）和水稻（Oryza sativa L.）的bZIP基因全長(zhǎng)蛋白序列為查詢,... 

【文章來源】：山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省

【文章頁數(shù)】：76 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

環(huán)境脅迫誘導(dǎo)基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)示意圖（劉強(qiáng)等，2000）

山東農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士專業(yè)學(xué)位論文圖2擬南芥和陸地棉bZIP基因系統(tǒng)發(fā)育分析Fig.2PhylogeneticanalysisofbZIPgeneinG.hirsutumandArabidopsisthaliana19

棉花bZIP基因家族全基因組鑒定及分析圖3陸地棉、亞洲棉和雷蒙德氏棉bZIP基因系統(tǒng)發(fā)育分析Fig.3PhylogeneticanalysisofbZIPgeneinG.hirsutum、G.arboreumandG.raimondii3.4bZIP基因結(jié)構(gòu)及蛋白保守基序分析對(duì)蛋白質(zhì)保守基序和基因結(jié)構(gòu)的分析是研究基因進(jìn)化的重要方法，本研究分別使用GSDS和MEME對(duì)三個(gè)棉種bZIP基因的蛋白保守和結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析。3.4.1陸地棉bZIP基因結(jié)構(gòu)及蛋白保守基序分析如圖4B所示，陸地棉bZIP基因的長(zhǎng)度、外顯子數(shù)量及外顯子長(zhǎng)度變化范圍較大，其中有45個(gè)基因只有1個(gè)外顯子、無內(nèi)含子，基因數(shù)量占陸地棉bZIP基因總數(shù)的29.8%，其中有44個(gè)基因都來自于S亞家族，1個(gè)基因Ghir_D06G003940來自于D亞家族。還有一個(gè)S亞家族的基因Ghir_A01G011110，含有1個(gè)外顯子和1個(gè)內(nèi)含子。大多數(shù)陸地棉bZIP基因含有4-6個(gè)外顯子，數(shù)量占陸地棉bZIP基因總數(shù)的53.6%，而其中含有420


本文編號(hào)：2917981