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蘭州大尾羊GHSR基因克隆與生長(zhǎng)性能的關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時(shí)間:2024-04-28 01:00
  生長(zhǎng)激素促分泌素受體(growth hormone secretagogue receptor,GHSR)是由366個(gè)氨基酸組成的多肽,屬于G-蛋白偶聯(lián)受體(GPCR)家族,由兩個(gè)外顯子和一個(gè)內(nèi)含子組成,擁有7次跨膜結(jié)構(gòu)。GHSR對(duì)垂體前葉釋放生長(zhǎng)激素和調(diào)節(jié)機(jī)體生長(zhǎng)發(fā)育起著重要作用。本研究通過(guò)RT-PCR克隆了蘭州大尾羊GHSR基因全長(zhǎng)并對(duì)其進(jìn)行了生物信息學(xué)分析,通過(guò)PCR結(jié)合瓊脂糖凝膠電泳發(fā)現(xiàn)了一個(gè)插入缺失多態(tài)性位點(diǎn),檢測(cè)了該位點(diǎn)在三種綿羊中的多態(tài)性及其與體重、體長(zhǎng)等生長(zhǎng)性狀的相關(guān)性,通過(guò)qRT-PCR檢測(cè)了GHSR基因在小尾寒羊和蘭州大尾羊不同組織中的表達(dá)水平,以期為綿羊的分子育種和品種選育提供理論基礎(chǔ)。研究結(jié)果如下:1.蘭州大尾羊GHSR基因的克隆及生物信息學(xué)分析蘭州大尾羊GHSR基因核苷酸序列編碼區(qū)全長(zhǎng)為1101bp,編碼366個(gè)氨基酸,與綿羊(蘭勃羊)、牛、野豬、馬、白犀、大鼠、小鼠、人、大猩猩同源性分別為99.64%、95.82%、91.11%、91.73%、91.55%、90.83%、89.92%、89.65%和89.83%,基因的保守性較高。蘭州大尾羊GHSR蛋白序列有...

【文章頁(yè)數(shù)】:54 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖2-1總RNA提取電泳圖

圖2-1總RNA提取電泳圖

西北民族大學(xué)生命科學(xué)與工程學(xué)院2016級(jí)特種經(jīng)濟(jì)動(dòng)物飼養(yǎng)碩士研究生畢業(yè)論文-12-質(zhì)序列進(jìn)行信號(hào)肽分析。使用PSORT(http://psort.nibb.ac.jp/)II軟件對(duì)蛋白的細(xì)胞內(nèi)定位進(jìn)行預(yù)測(cè)。使用SOMPA在線軟件(npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bi....


圖2-2GHSR基因PCR擴(kuò)增結(jié)果

圖2-2GHSR基因PCR擴(kuò)增結(jié)果

西北民族大學(xué)生命科學(xué)與工程學(xué)院2016級(jí)特種經(jīng)濟(jì)動(dòng)物飼養(yǎng)碩士研究生畢業(yè)論文-13-注:A為PCR擴(kuò)增產(chǎn)物圖2-2GHSR基因PCR擴(kuò)增結(jié)果Figure2-2GHSRGenePCRamplificationresults2.3.2GHSR基因的生物信息學(xué)分析2.3.2.1核苷酸序列....


圖2-3GHSR基因系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)

圖2-3GHSR基因系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)

西北民族大學(xué)生命科學(xué)與工程學(xué)院2016級(jí)特種經(jīng)濟(jì)動(dòng)物飼養(yǎng)碩士研究生畢業(yè)論文-14-圖2-3GHSR基因系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)Figure2-3GHSRGenePhylogeneticTree2.3.3蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)2.3.3.1理化性質(zhì)表2-2蘭州大尾羊GHSR蛋白氨基酸組成Table2-2A....


圖2-4蘭州大尾羊GHSR蛋白跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)

圖2-4蘭州大尾羊GHSR蛋白跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)

西北民族大學(xué)生命科學(xué)與工程學(xué)院2016級(jí)特種經(jīng)濟(jì)動(dòng)物飼養(yǎng)碩士研究生畢業(yè)論文-15-Da,理論等電點(diǎn)為8.77,脂溶指數(shù)為108.09,不穩(wěn)定系數(shù)為45.64,表明該蛋白屬于不穩(wěn)定的脂溶性蛋白。總原子數(shù)5904。半衰期為30h(哺乳動(dòng)物紅細(xì)胞)>20h(酵母體內(nèi))>10h(大腸桿菌....



本文編號(hào):3965955

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