基于核糖體DNA第二內(nèi)轉錄間隔區(qū)基因的9種蚊蟲分子鑒定
發(fā)布時間:2020-12-09 12:51
目的分析常見9種蚊蟲核糖體DNA第二內(nèi)轉錄間隔區(qū)(rDNA-ITS2)基因序列特征,為蚊蟲種類分子鑒定方法探討提供依據(jù)。方法在山東省濟寧市采集淡色庫蚊、三帶喙庫蚊、二帶喙庫蚊、白紋伊蚊、刺擾伊蚊、中華按蚊、騷擾阿蚊、常型曼蚊和黃色柯蚊成蚊,形態(tài)學種類鑒定后,提取上述9種蚊蟲DNA,PCR擴增rDNA-ITS2基因并測序;在GenBank中進行同源性比對,采用Bioedit 7.0軟件及DNAMAN軟件對測序結果進行比對分析,通過DNASTAR、ClustalX 1.81和Mega6軟件分析列特征并構建系統(tǒng)進化樹探討系統(tǒng)發(fā)生關系。結果 9種蚊蟲的rDNAITS2長度在343 bp與577 bp之間,共有59個保守位點、449個變異位點、235個簡約信息位點和191個單態(tài)位點,9種蚊蟲種間序列同源性為28.21%~53.76%;所有蚊蟲的rDNA-ITS2基因分子鑒定與形態(tài)學鑒定吻合率100%,庫蚊屬的淡色庫蚊、三帶喙庫蚊和二帶喙庫蚊聚成一類,伊紋屬的白紋伊蚊和刺擾伊蚊聚成一類,不同種蚊蟲為獨立分支。結論核糖體DNA第二內(nèi)轉錄間隔(rDNA-ITS2)基因可用于蚊蟲屬和種的鑒定。
【文章來源】:熱帶病與寄生蟲學. 2020年01期 第12-16頁
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
9種蚊種的r DNA-ITS2基因PCR產(chǎn)物電泳結果
采用NJ法和UPGMA法構建系統(tǒng)進化樹,所有系統(tǒng)數(shù)樹支上數(shù)值為1 000次Bootstrap檢測得到的對該支的支持百分數(shù)。從圖中可以看出這兩種不同的分子系統(tǒng)樹具有大致相同的拓撲結構,庫蚊屬的淡色庫蚊、三帶喙庫蚊和二帶喙庫蚊聚成一類,伊紋屬的白紋伊蚊和刺擾伊蚊聚成一類,但這兩個系統(tǒng)中,騷擾阿蚊、黃色柯蚊、常型曼蚊和中華按蚊的位置有所不同。在NJ樹中,該四種蚊蟲為獨立分支,而UPGMA樹中,騷擾阿蚊和黃色柯蚊聚為一類(圖2)。討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]9種蚊蟲細胞色素C氧化酶亞基Ⅰ基因的分子進化分析[J]. 郭秀霞,程鵬,劉麗娟,史琦琪,王海防,張崇星,王懷位,公茂慶. 中國媒介生物學及控制雜志. 2017(06)
[2]山東省淡色庫蚊核糖體DNA第二內(nèi)轉錄間隔區(qū)基因多態(tài)性分析[J]. 劉飛,郭秀霞,程鵬,王海防,劉麗娟,楊培培,趙玉強,王懷位,公茂慶. 中國媒介生物學及控制雜志. 2015(06)
[3]核糖體DNA序列分析在昆蟲系統(tǒng)學研究中的應用[J]. 江世宏,孟子燁,陳曉琴,李廣京. 昆蟲分類學報. 2008(03)
[4]廣東國境口岸五種蚊種核糖體基因第2內(nèi)轉錄間隔區(qū)分子鑒定方法研究[J]. 師永霞,幸蘆琴,洪燁,李小波,郭波旋,相大鵬,黃吉城,鄭夔. 中國國境衛(wèi)生檢疫雜志. 2008(01)
[5]一種簡便的赫坎按蚊復合體近緣種按蚊基因鑒別新技術[J]. 高琪,周華云,Cooper R.D,李鳳華,蘇云普,朱國鼎,曹俊,Beebe N.W. 中國人獸共患病雜志. 2005(03)
[6]不同蚊種核糖體DNA第二內(nèi)轉錄間隔區(qū)的PCR擴增[J]. 徐建農(nóng),瞿逢伊,董學書. 第二軍醫(yī)大學學報. 1996(02)
本文編號:2906889
【文章來源】:熱帶病與寄生蟲學. 2020年01期 第12-16頁
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
9種蚊種的r DNA-ITS2基因PCR產(chǎn)物電泳結果
采用NJ法和UPGMA法構建系統(tǒng)進化樹,所有系統(tǒng)數(shù)樹支上數(shù)值為1 000次Bootstrap檢測得到的對該支的支持百分數(shù)。從圖中可以看出這兩種不同的分子系統(tǒng)樹具有大致相同的拓撲結構,庫蚊屬的淡色庫蚊、三帶喙庫蚊和二帶喙庫蚊聚成一類,伊紋屬的白紋伊蚊和刺擾伊蚊聚成一類,但這兩個系統(tǒng)中,騷擾阿蚊、黃色柯蚊、常型曼蚊和中華按蚊的位置有所不同。在NJ樹中,該四種蚊蟲為獨立分支,而UPGMA樹中,騷擾阿蚊和黃色柯蚊聚為一類(圖2)。討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]9種蚊蟲細胞色素C氧化酶亞基Ⅰ基因的分子進化分析[J]. 郭秀霞,程鵬,劉麗娟,史琦琪,王海防,張崇星,王懷位,公茂慶. 中國媒介生物學及控制雜志. 2017(06)
[2]山東省淡色庫蚊核糖體DNA第二內(nèi)轉錄間隔區(qū)基因多態(tài)性分析[J]. 劉飛,郭秀霞,程鵬,王海防,劉麗娟,楊培培,趙玉強,王懷位,公茂慶. 中國媒介生物學及控制雜志. 2015(06)
[3]核糖體DNA序列分析在昆蟲系統(tǒng)學研究中的應用[J]. 江世宏,孟子燁,陳曉琴,李廣京. 昆蟲分類學報. 2008(03)
[4]廣東國境口岸五種蚊種核糖體基因第2內(nèi)轉錄間隔區(qū)分子鑒定方法研究[J]. 師永霞,幸蘆琴,洪燁,李小波,郭波旋,相大鵬,黃吉城,鄭夔. 中國國境衛(wèi)生檢疫雜志. 2008(01)
[5]一種簡便的赫坎按蚊復合體近緣種按蚊基因鑒別新技術[J]. 高琪,周華云,Cooper R.D,李鳳華,蘇云普,朱國鼎,曹俊,Beebe N.W. 中國人獸共患病雜志. 2005(03)
[6]不同蚊種核糖體DNA第二內(nèi)轉錄間隔區(qū)的PCR擴增[J]. 徐建農(nóng),瞿逢伊,董學書. 第二軍醫(yī)大學學報. 1996(02)
本文編號:2906889
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