MEK1/2全長結(jié)構(gòu)及磷酸化激活的分子機理的計算結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究
【文章頁數(shù)】:113 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.MAPK信號通路示意圖
軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院碩士學(xué)位論文前言receptor)、PDGFR(platelet-derivedgrowthfactorreceptor)和TRK(tyrosinekinasereceptor)A,B等。活化的RAF可將MEK的兩個特定絲氨酸磷酸化,使MEK....
圖31S9件為
軍事圖2*號插入有明序列這種ERK事醫(yī)學(xué)科學(xué)院碩2.MEK1和表示相同氨入的空格。MEK1和明顯構(gòu)象差列比對顯示種序列差異K/MAPK通碩士學(xué)位論文MEK2的序氨基酸,:表序列比對軟MEK2具有差異(圖3)。示,MEK1和異與其功能通路在MEK序列比對圖表示保....
圖1.1,利用SOPMA服務(wù)器[35]對MEK1和MEK2進行二級結(jié)構(gòu)預(yù)測的結(jié)果
軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第一部分MEK分子完整三維結(jié)構(gòu)的構(gòu)建致,因此在該區(qū)域很可能會形成一個長螺旋。因此我們選擇對MEKN端缺失部分進行單獨手動構(gòu)建多肽并進行分子動力學(xué)模擬,通過對其模擬軌跡的分析研究它的從頭折疊過程,從而獲得合適的構(gòu)象后進行MEK完整三維結(jié)構(gòu)的....
圖1.2,M64和M68初始結(jié)構(gòu)圖
覆蓋二級結(jié)構(gòu)預(yù)測顯示的螺旋區(qū)域(MEK1中的Ala26-Glu62,MEK2中的Ser30-Glu66),這樣選擇的好處是可以獲得一個完整的螺旋,有下一步進行結(jié)構(gòu)構(gòu)建;四,MEK1和MEK2選擇的序列必須要符合比對的結(jié)果,便于進一步MEK1和MEK2的N端....
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