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多房棘球絳蟲鈣網(wǎng)蛋白結(jié)構(gòu)和功能的生物信息學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2024-06-24 20:04
  為進(jìn)一步研究多房棘球絳蟲的致病性、藥物靶點(diǎn)以及疫苗診斷試劑的開發(fā)提供理論依據(jù),應(yīng)用生物信息學(xué)方法預(yù)測(cè)分析多房棘球絳蟲(Echinococcus multilocularis,Em)鈣網(wǎng)蛋白(Calreticulin,CRT)的結(jié)構(gòu)和功能。通過基因組數(shù)據(jù)庫(kù)收集數(shù)據(jù)確定Em-CRT基因和氨基酸序列;利用生物信息學(xué)軟件分別對(duì)Em-CRT進(jìn)行蛋白質(zhì)基本性質(zhì)、翻譯后修飾位點(diǎn)、功能域、亞細(xì)胞定位、二/三級(jí)結(jié)構(gòu)、親/疏水性、抗原表位以及進(jìn)化關(guān)系等進(jìn)行預(yù)測(cè)和分析。結(jié)果表明:Em-CRT基因轉(zhuǎn)錄本長(zhǎng)度為1 188 bp,蛋白全長(zhǎng)為395個(gè)氨基酸殘基,分子量大小約為45.44 kDa,等電點(diǎn)(pI)為4.47,為穩(wěn)定蛋白,親水性較高,可溶于水;具有信號(hào)肽和信號(hào)肽酶剪切位點(diǎn),為膜外蛋白;Em-CRT具有N端糖基化位點(diǎn),酪氨酸激酶(TK)Ⅱ磷酸化位點(diǎn),cAMP和cGMP依賴蛋白激酶磷酸化位點(diǎn),N端肉豆蔻;稽c(diǎn),蛋白激酶C磷酸化位點(diǎn),酪氨酸激酶磷酸化位點(diǎn);二級(jí)結(jié)構(gòu)以無規(guī)則卷曲和α螺旋為主;Em-CRT具有良好的T,B細(xì)胞抗原表位。所以,Em-CRT對(duì)多房棘球絳蟲個(gè)體發(fā)育具有重要的作用,且與多房棘球蚴感染免疫密...

【文章頁數(shù)】:7 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備
    1.2 蛋白質(zhì)特性預(yù)測(cè)分析
    1.3 蛋白抗原表位分析
    1.4 分子進(jìn)化分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 Em-CRT蛋白基本性質(zhì)
    2.2 CD4+T 細(xì)胞抗原表位結(jié)果
    2.3 CD8+T 細(xì)胞抗原表位結(jié)果
    2.4 B細(xì)胞抗原表位綜合分析
    2.5 分子進(jìn)化分析
3 討論與結(jié)論



本文編號(hào):3995704

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