多房棘球絳蟲鈣網(wǎng)蛋白結構和功能的生物信息學研究
發(fā)布時間:2024-06-24 20:04
為進一步研究多房棘球絳蟲的致病性、藥物靶點以及疫苗診斷試劑的開發(fā)提供理論依據(jù),應用生物信息學方法預測分析多房棘球絳蟲(Echinococcus multilocularis,Em)鈣網(wǎng)蛋白(Calreticulin,CRT)的結構和功能。通過基因組數(shù)據(jù)庫收集數(shù)據(jù)確定Em-CRT基因和氨基酸序列;利用生物信息學軟件分別對Em-CRT進行蛋白質基本性質、翻譯后修飾位點、功能域、亞細胞定位、二/三級結構、親/疏水性、抗原表位以及進化關系等進行預測和分析。結果表明:Em-CRT基因轉錄本長度為1 188 bp,蛋白全長為395個氨基酸殘基,分子量大小約為45.44 kDa,等電點(pI)為4.47,為穩(wěn)定蛋白,親水性較高,可溶于水;具有信號肽和信號肽酶剪切位點,為膜外蛋白;Em-CRT具有N端糖基化位點,酪氨酸激酶(TK)Ⅱ磷酸化位點,cAMP和cGMP依賴蛋白激酶磷酸化位點,N端肉豆蔻酰化位點,蛋白激酶C磷酸化位點,酪氨酸激酶磷酸化位點;二級結構以無規(guī)則卷曲和α螺旋為主;Em-CRT具有良好的T,B細胞抗原表位。所以,Em-CRT對多房棘球絳蟲個體發(fā)育具有重要的作用,且與多房棘球蚴感染免疫密...
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 數(shù)據(jù)準備
1.2 蛋白質特性預測分析
1.3 蛋白抗原表位分析
1.4 分子進化分析
2 結果與分析
2.1 Em-CRT蛋白基本性質
2.2 CD4+T 細胞抗原表位結果
2.3 CD8+T 細胞抗原表位結果
2.4 B細胞抗原表位綜合分析
2.5 分子進化分析
3 討論與結論
本文編號:3995704
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1 材料與方法
1.1 數(shù)據(jù)準備
1.2 蛋白質特性預測分析
1.3 蛋白抗原表位分析
1.4 分子進化分析
2 結果與分析
2.1 Em-CRT蛋白基本性質
2.2 CD4+T 細胞抗原表位結果
2.3 CD8+T 細胞抗原表位結果
2.4 B細胞抗原表位綜合分析
2.5 分子進化分析
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