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FLW牛UCP3、THRSP基因單核苷酸多態(tài)性與生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時間:2021-04-20 09:32
  隨著分子技術(shù)的發(fā)展和牛基因組計劃的初步完成,使得運用分子標(biāo)記技術(shù)進行標(biāo)記輔助選擇(MAS)成為可能,單核苷酸多態(tài)性(SNP)作為分子標(biāo)記技術(shù)的熱點之一,肉牛育種工作者運用此技術(shù)來實現(xiàn)人們生活消費品質(zhì)為標(biāo)志的肉品質(zhì)性狀和肉牛生長狀態(tài)為標(biāo)志的胴體性狀兩個目標(biāo)的選育。此實驗通過分子生物學(xué)和生物信息學(xué)相結(jié)合,對65頭牛中UCP3和THRSP基因上的12個SNPs多態(tài)性與12個性狀之間進行了關(guān)聯(lián)分析,同時測定兩個基因在不同大理石等級群體中的表達差異,得到了相關(guān)數(shù)據(jù),獲得了如下結(jié)果:1.利用測序和PCR-RFLP方法檢測到UCP3基因的5個SNPs,利用線性模型對5個SNP多態(tài)性位點基因型與胴體性狀和肉品質(zhì)性狀進行了關(guān)聯(lián)分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn):UCP3第五內(nèi)含子的5個SNPs位點。(1)C786G位點CG型個體脂色等級和脂肪含量明顯高于CC型個體(P0.05);位點CC型個體鮮肉水分含量明顯高于CG型個體(P0.05)。(2)C782G位點CG型個體脂色等級和脂肪含量明顯高于CC型個體(P0.05);位點CC型個體鮮肉水分含量明顯高于CG型個體(P0.05)。(3)A559G位點AG型個體脂色等級和脂肪含量明顯高于AA型個體(P0.05);位點AA型個體鮮肉水分含量明顯高于AG型個體(P0.05)。(4)C508T位點所對應(yīng)的各個性狀均未達到差異顯著。(5)G457T位點GT型個體屠宰前重、眼肌肉長、三角牛腩等級、背膘脂肪厚、脂色等級、肉色等級、大理石花紋等級明顯高于GG型個體(P0.05);GG型個體鮮肉水分含量高于GT型個體。2.利用測序和PCR-RFLP方法檢測到THRSP基因的7個SNP位點,利用線性模型對7個SNP多態(tài)性位點基因型與胴體性狀和肉品質(zhì)性狀進行了關(guān)聯(lián)分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn):THRSP第一內(nèi)含子的6個SNP位點。(1)Intronl中A790C、A724G、T682C、T470C、G378A五個位點所對應(yīng)的各個性狀均未達到差異顯著。(2)Intronl中T448C位點TC型個體大理石花紋等級明顯高于TT型個體(P0.05)。(3)THRSP第一外顯子存在1個SNP位點A193G,此位點AA型對應(yīng)的鮮肉水含量明顯較高(P0.05);AG型個體脂肪含量較高(P0.05)。3.UCP3在大理石花紋等級差異明顯的兩組個體相應(yīng)表達量均無顯著差異(P0.05);THRSP在大理石花紋等級高的個體相應(yīng)表達量明顯高于等級低的個體(P0.05)。
【學(xué)位授予單位】:山西農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:S823.92
文章目錄
摘要
1 前言
    1.1 肉牛發(fā)展概況
    1.2 UCP3、THRSP基因的研究進展
        1.2.1 UCP3基因研究進展
        1.2.2 THRSP基因研究進展
    1.3 三種常見的SNP檢測方法概述
        1.3.1 SNP標(biāo)記在家畜育種中的應(yīng)用
        1.3.2 測序法
        1.3.3 PCR-RFLP方法
        1.3.4 PCR-SSCP方法
    1.4 熒光定量PCR概述
        1.4.1 熒光定量PCR的簡介
        1.4.2 熒光定量PCR的基本原理
        1.4.3 熒光定量PCR定量分析的兩種方法
        1.4.4 熒光定量PCR的優(yōu)點
    1.5 本實驗的研究內(nèi)容及意義
2 材料與方法
    2.1 實驗材料
        2.1.1 實驗動物
        2.1.2 實驗主要試劑耗材
        2.1.3 實驗主要儀器設(shè)備
        2.1.4 常用溶液及試劑的配制
        2.1.5 主要分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫及分析軟件
    2.2 實驗方法
        2.2.1 實驗動物屠宰及分割
        2.2.2 評價指標(biāo)和計算方法
        2.2.3 肌內(nèi)脂肪含量測定方法
        2.2.4 引物設(shè)計及分析軟件
        2.2.5 UCP3基因與THRSP基因SNP位點的確定
        2.2.6 利用實時熒光定量PCR技術(shù)對肌肉UCP3基因和THRSP基因的mRNA進行相對定量
        2.2.7 數(shù)據(jù)分析
3 結(jié)果與分析
    3.1 總DNA提取結(jié)果
    3.2 UCP3與THRSP基因DNA部分片段擴增結(jié)果鑒定
    3.3 UCP3與THRSP基因SNPs位點的檢測及關(guān)聯(lián)分析
        3.3.1 UCP3基因SNPs位點的確認及關(guān)聯(lián)分析
        3.3.2 THRSP基因SNPs位點的確認及關(guān)聯(lián)分析
    3.4 牛的總RNA檢測
    3.5 UCP3、THRSP、B-ACTIN基因DNA部分片段擴增結(jié)果檢測
    3.6 UCP3、THRSP基因相對定量標(biāo)準(zhǔn)曲線和溶解曲線
    3.7 UCP3、THRSP基因相對表達量及相關(guān)分析
        3.7.1 UCP3基因mRNA表達量測定結(jié)果
        3.7.2 THRSP基因mRNA表達量測定結(jié)果
4 討論
    4.1 全文討論
    4.2 實驗動物背景討論
    4.3 實時熒光定量PCR技術(shù)討論
結(jié)論
參考文獻
Abstract
附錄1
附錄2
致謝

【參考文獻】

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本文編號:1592402

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