慢性乙型肝炎患者IFN-α治療無應(yīng)答與肝組織基因表達(dá)差異關(guān)系的初步研究
發(fā)布時(shí)間:2020-12-03 00:44
目的:利用基因芯片技術(shù)檢測(cè)慢性乙型肝炎患者α干擾素(IFN-α)治療應(yīng)答者(Rs)和無應(yīng)答者(NRs)之間肝組織的表達(dá)基因差異,探討IFN-α治療慢乙肝無應(yīng)答的分子機(jī)制。方法:采用表達(dá)譜基因芯片檢測(cè)IFN-α治療前患者肝組織的全基因表達(dá)情況,篩選出在7例治療無應(yīng)答者和6例治療應(yīng)答者之間差異表達(dá)的基因,對(duì)這些差異基因進(jìn)行Gene Ontology分析和KEGG通路分析,并對(duì)部分明顯差異表達(dá)基因進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證。結(jié)果:在NRs和Rs組共篩選出3592個(gè)差異表達(dá)基因(P <0 .05),而這些差異基因主要集中在干擾素誘導(dǎo)基因(ISGs)和免疫調(diào)節(jié)相關(guān)基因,且ISGs在治療前的NRs高表達(dá)而免疫調(diào)節(jié)相關(guān)基因低表達(dá)。其中,處于一條抑制干擾素信號(hào)通路的兩個(gè)ISGs(USP18和CEB1)在NRs高表達(dá),而具有潛在抗病毒活性的ISG20基因在NRs低表達(dá),這可能和IFN-α治療無應(yīng)答密切相關(guān)。結(jié)論:NRs和Rs在IFN-α治療前即具有不同的肝臟基因表達(dá)譜,在治療前高表達(dá)具有抑制IFN通路的ISGs并抑制免疫反應(yīng)將預(yù)示著治療無應(yīng)答,并可望在治療前成功預(yù)測(cè)IFN-α治療效果。
【文章來源】:重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市
【文章頁數(shù)】:49 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
熒光標(biāo)記反應(yīng)示意圖
圖 2 總 RNA 電泳圖Figure 2 Electrophoresis Image異表達(dá)基因篩選結(jié)果 Rs 組和 NRs 組共篩選出 3592 個(gè)差異表達(dá)基因(P 值和 FDR 均<0.05,數(shù)>1.3),其中 1556 個(gè)基因在 IFN-α 治療前的 NRs 組高表達(dá),而 2036達(dá)。利用 Cluster3.0 軟件進(jìn)行無監(jiān)督遺傳聚類分析,發(fā)現(xiàn)這 3592 個(gè)差分為兩個(gè)聚類,在無應(yīng)答組是一個(gè)聚類而在應(yīng)答組是另一個(gè)聚類(見圖可以說明這 3592 個(gè)基因在 NRs 和 Rs 是有顯著差異的。
圖 2 總 RNA 電泳圖Figure 2 Electrophoresis Ima2.3 差異表達(dá)基因篩選結(jié)果在 Rs 組和 NRs 組共篩選出 3592 個(gè)差異表達(dá)基因(P差異倍數(shù)>1.3),其中 1556 個(gè)基因在 IFN-α 治療前的 NRs因低表達(dá)。利用 Cluster3.0 軟件進(jìn)行無監(jiān)督遺傳聚類分析因可以分為兩個(gè)聚類,在無應(yīng)答組是一個(gè)聚類而在應(yīng)答組因此,可以說明這 3592 個(gè)基因在 NRs 和 Rs 是有顯著差異
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Cloning,Eukaryotic Expression of Human ISG20 and Preliminary Study on the Effect of Its Anti-HBV[J]. 郝友華,楊東亮. Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences). 2008(01)
[2]Relationship of human leukocyte antigen class II genes with the susceptibility to hepatitis B virus infection and the response to interferon in HBV-infected patients[J]. Yong-Nian Han, Jin-Long Yang, Shui-Gen Zheng, Qun Tang, Wei Zhu, Research Unit of Liver Diseases, Shanghai 8~(th) People’s Hospital, Shanghai 200235, China. World Journal of Gastroenterology. 2005(36)
[3]In vitro resistance to interferon of hepatitis B virus with precore mutation[J]. Yan Wang, Lai Wei, Dong Jiang, Xu Cong, Ran Fei, Jiang Xiao, Yu Wang, Hepatology Institute, Peking University People’s Hospital, Beijing 100044, China. World Journal of Gastroenterology. 2005(05)
[4]慢性乙型肝炎干擾素療效與人類白細(xì)胞抗原-等位基因的關(guān)系[J]. 奚敏,臧國慶,馮明亮,季蕓. 中華傳染病雜志. 2004(04)
[5]Gene expression profiles in an hepatitis B virus transfected hepatoblastoma cell line and differentially regulated gene expression by interferon-α[J]. Xun Wang Zheng-Hong Yuan Ling-Jie Zheng Wei Xiong JiangXia Liu,Department of Molecular Virology,Shanghai Medical College,Fudan University,Shanghai 200032,ChinaFeng Yu Gen-Xi Hu,Institute of Biochemistry and Cell Biology,CAS,Shanghai 20003 I,ChinaYao Li,State Key Laboratory of Genetics,Fudan University School of Life Science,Shanghai 200433,China. World Journal of Gastroenterology. 2004(12)
[6]基因芯片分析干擾素對(duì)乙型肝炎病毒轉(zhuǎn)染細(xì)胞基因表達(dá)的影響(英文)[J]. 熊煒,王迅,劉曉穎,項(xiàng)黎,鄭玲潔,劉江霞,袁正宏. 生物化學(xué)與生物物理學(xué)報(bào). 2003(12)
[7]丙型肝炎病毒基因型及患者人類白細(xì)胞抗原對(duì)其抗病毒療效的影響[J]. 焦健,王江濱. 中華肝臟病雜志. 2003(10)
[8]粘病毒抵抗蛋白A和真核細(xì)胞起始因子2α調(diào)節(jié)區(qū)2基因多態(tài)性與慢性乙型肝炎干擾素治療效果的相關(guān)性[J]. 黃雁翔,馬麗娜,陳新月,李卓,黃云麗,沈成利,馬冰. 中華肝臟病雜志. 2007 (03)
本文編號(hào):2895713
【文章來源】:重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市
【文章頁數(shù)】:49 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
熒光標(biāo)記反應(yīng)示意圖
圖 2 總 RNA 電泳圖Figure 2 Electrophoresis Image異表達(dá)基因篩選結(jié)果 Rs 組和 NRs 組共篩選出 3592 個(gè)差異表達(dá)基因(P 值和 FDR 均<0.05,數(shù)>1.3),其中 1556 個(gè)基因在 IFN-α 治療前的 NRs 組高表達(dá),而 2036達(dá)。利用 Cluster3.0 軟件進(jìn)行無監(jiān)督遺傳聚類分析,發(fā)現(xiàn)這 3592 個(gè)差分為兩個(gè)聚類,在無應(yīng)答組是一個(gè)聚類而在應(yīng)答組是另一個(gè)聚類(見圖可以說明這 3592 個(gè)基因在 NRs 和 Rs 是有顯著差異的。
圖 2 總 RNA 電泳圖Figure 2 Electrophoresis Ima2.3 差異表達(dá)基因篩選結(jié)果在 Rs 組和 NRs 組共篩選出 3592 個(gè)差異表達(dá)基因(P差異倍數(shù)>1.3),其中 1556 個(gè)基因在 IFN-α 治療前的 NRs因低表達(dá)。利用 Cluster3.0 軟件進(jìn)行無監(jiān)督遺傳聚類分析因可以分為兩個(gè)聚類,在無應(yīng)答組是一個(gè)聚類而在應(yīng)答組因此,可以說明這 3592 個(gè)基因在 NRs 和 Rs 是有顯著差異
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Cloning,Eukaryotic Expression of Human ISG20 and Preliminary Study on the Effect of Its Anti-HBV[J]. 郝友華,楊東亮. Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences). 2008(01)
[2]Relationship of human leukocyte antigen class II genes with the susceptibility to hepatitis B virus infection and the response to interferon in HBV-infected patients[J]. Yong-Nian Han, Jin-Long Yang, Shui-Gen Zheng, Qun Tang, Wei Zhu, Research Unit of Liver Diseases, Shanghai 8~(th) People’s Hospital, Shanghai 200235, China. World Journal of Gastroenterology. 2005(36)
[3]In vitro resistance to interferon of hepatitis B virus with precore mutation[J]. Yan Wang, Lai Wei, Dong Jiang, Xu Cong, Ran Fei, Jiang Xiao, Yu Wang, Hepatology Institute, Peking University People’s Hospital, Beijing 100044, China. World Journal of Gastroenterology. 2005(05)
[4]慢性乙型肝炎干擾素療效與人類白細(xì)胞抗原-等位基因的關(guān)系[J]. 奚敏,臧國慶,馮明亮,季蕓. 中華傳染病雜志. 2004(04)
[5]Gene expression profiles in an hepatitis B virus transfected hepatoblastoma cell line and differentially regulated gene expression by interferon-α[J]. Xun Wang Zheng-Hong Yuan Ling-Jie Zheng Wei Xiong JiangXia Liu,Department of Molecular Virology,Shanghai Medical College,Fudan University,Shanghai 200032,ChinaFeng Yu Gen-Xi Hu,Institute of Biochemistry and Cell Biology,CAS,Shanghai 20003 I,ChinaYao Li,State Key Laboratory of Genetics,Fudan University School of Life Science,Shanghai 200433,China. World Journal of Gastroenterology. 2004(12)
[6]基因芯片分析干擾素對(duì)乙型肝炎病毒轉(zhuǎn)染細(xì)胞基因表達(dá)的影響(英文)[J]. 熊煒,王迅,劉曉穎,項(xiàng)黎,鄭玲潔,劉江霞,袁正宏. 生物化學(xué)與生物物理學(xué)報(bào). 2003(12)
[7]丙型肝炎病毒基因型及患者人類白細(xì)胞抗原對(duì)其抗病毒療效的影響[J]. 焦健,王江濱. 中華肝臟病雜志. 2003(10)
[8]粘病毒抵抗蛋白A和真核細(xì)胞起始因子2α調(diào)節(jié)區(qū)2基因多態(tài)性與慢性乙型肝炎干擾素治療效果的相關(guān)性[J]. 黃雁翔,馬麗娜,陳新月,李卓,黃云麗,沈成利,馬冰. 中華肝臟病雜志. 2007 (03)
本文編號(hào):2895713
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