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長江中下游地區(qū)水體中盔形溞的遺傳多樣性和微進化研究

發(fā)布時間:2024-10-03 06:51
  長江中下游地區(qū)是我國富營養(yǎng)化湖泊分布的主要區(qū)域,不同湖泊水環(huán)境的差異可能導致水體中枝角類的遺傳多樣性發(fā)生變化。盔形溞(Daphnia galeata)作為溞屬枝角類中的重要類群之一,在長江中下游地區(qū)分布廣泛,常被用作模式生物。本文以盔形溞(D.galeata)為研究對象,以16S rDNA和CO I基因作為分子標記,將兩種基因序列拼接,研究了長江中下游地區(qū)7個湖泊中盔形溞種群的遺傳多樣性及遺傳分化。以巢湖為例,分析了長江中下游湖泊不同沉積層(A:1-3 cm,B:4-6 cm,C:7-9 cm,D:≥10 cm)中盔形溞遺傳多樣性的變化特征。主要研究結果如下:1.將16S rDNA和CO I基因序列拼接后,在7個盔形溞種群的152個個體中,共檢測到變異位點54個,單倍型33個。單倍型多樣性(Hd)和核苷酸多樣性(π)指數分別為0.69和0.37%。種群內單倍型多樣性和核苷酸多樣性的變異范圍分別是0.34~0.84和0.05%0.55%。7個盔形溞種群的遺傳分化系數Fst為0.05。中性檢驗結果顯示,長江中下游地區(qū)水體中盔形溞種群在歷史上經歷了瓶頸效應。AMOVA分析...

【文章頁數】:66 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖1溞屬種類的生活史特點(引自呂凱[34]

圖1溞屬種類的生活史特點(引自呂凱[34]

分布圖1溞屬種類的生活史特點(引自呂凱[34])Figure1LifehistorycharacteristicsofDaphniaspec


圖2基于16SrDNA、COI基因及兩者拼接構建的盔形溞單倍型網絡圖(A:16SrDNA基因序列,B:COI基因序列,C:16SrDNA和COI拼接序列

圖2基于16SrDNA、COI基因及兩者拼接構建的盔形溞單倍型網絡圖(A:16SrDNA基因序列,B:COI基因序列,C:16SrDNA和COI拼接序列

圖2基于16SrDNA、COI基因及兩者拼接構建的盔形溞單倍型網絡圖(A:16SrDNA基因序列,B:COI基因序列,C:16SrDNA和COI拼接序列。圓圈中不同的顏色代表不同湖泊的種群)Figure2Haplotypenetworkbas....


圖3基于16SrDNA和COI基因序列組合的7個長江中下游湖泊中盔形溞種群單倍型的頻率及地理分布

圖3基于16SrDNA和COI基因序列組合的7個長江中下游湖泊中盔形溞種群單倍型的頻率及地理分布

在位于長江下游的TH種群中也有發(fā)現(圖3)。圖2基于16SrDNA、COI基因及兩者拼接構建的盔形溞單倍型網絡圖(A:16SrDNA基因序列,B:COI基因序列,C:16SrDNA和COI拼接序列。圓圈中不同的顏色代表不同湖泊的種群)Figure....


圖4基于盔形溞16SrDNA基因序列構建的N-J系統(tǒng)進化樹(不同的顏色代表不同種群)

圖4基于盔形溞16SrDNA基因序列構建的N-J系統(tǒng)進化樹(不同的顏色代表不同種群)

圖4基于盔形溞16SrDNA基因序列構建的N-J系統(tǒng)進化樹(不同的顏色代表不同種群)Figure4Phylogenetictreeconstructedby16SrDNAgenesequenceofD.galeata.Differentco....



本文編號:4006884

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