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結(jié)合連鎖與關(guān)聯(lián)分析剖析玉米耐低鋅、鐵脅迫的遺傳機(jī)制

發(fā)布時(shí)間:2017-12-09 16:07

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【摘要】:鋅與鐵是植物不可或缺的營養(yǎng)元素,但其溶解性低而難于被植物吸收利用。缺鋅與缺鐵均會(huì)造成作物產(chǎn)量與質(zhì)量的下降,而玉米作為三大糧食作物之一,解析玉米耐低鋅、耐低鐵脅迫差異的遺傳機(jī)制對(duì)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)與發(fā)展有重要的實(shí)際意義。本研究在分別利用20與18個(gè)玉米自交系系統(tǒng)研究了不同玉米自交系耐低鋅、耐低鐵脅迫差異,并根據(jù)前期材料篩選結(jié)果,選用6個(gè)親本構(gòu)建的4個(gè)重組自交系群體和由來自全球508份玉米自交系組成的關(guān)聯(lián)群體為遺傳材料,結(jié)合連鎖及全基因組關(guān)聯(lián)分析,對(duì)玉米耐低鋅、耐低鐵脅迫差異的遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行剖析,為玉米耐低鋅、耐低鐵脅迫的遺傳改良提供指導(dǎo)、基因來源與材料來源。主要研究結(jié)果如下:1.Ye478與CI7未表現(xiàn)出缺鋅癥狀,為耐低鋅自交系。Wu312與K22缺鋅癥狀顯著,為鋅敏感自交系。株高、地上部與根系干物重、根冠比、地上部與根系鋅效率、鋅累積量均是評(píng)價(jià)玉米自交系耐低鋅脅迫能力的良好指標(biāo)。在低鋅條件下,玉米能通過地上部能夠?qū)⒆陨淼墓夂袭a(chǎn)物優(yōu)先分配給根系,以促進(jìn)根系生長。不同玉米自交系間鋅效率差異不是由吸收效率引起的,而可能與鋅的轉(zhuǎn)運(yùn)效率有關(guān)。2.本研究結(jié)合連鎖群體 Wu312×Ye478、K22×Dan340、K22×By815、K22×CI7,以及不同低鋅水平下兩批關(guān)聯(lián)群體試驗(yàn),針對(duì)玉米耐低鋅脅迫相關(guān)表型進(jìn)行分析。結(jié)果顯示,4個(gè)RIL群體共定位到136個(gè)QTL,在8條染色體上有20個(gè)不同群體共同定位區(qū)間,包括2個(gè)3群體共定位區(qū)間,18個(gè)2群體共定位區(qū)間。在全基因組顯著水平下,檢測到25個(gè)獨(dú)立位點(diǎn)與玉米耐低鋅脅迫顯著關(guān)聯(lián),其中13個(gè)位點(diǎn)位于4個(gè)連鎖群體的定位區(qū)間內(nèi)。通過對(duì)顯著位點(diǎn)上下游50 kb范圍內(nèi)所包括的78個(gè)候選基因進(jìn)行功能注釋,除6個(gè)未知功能的基因外,發(fā)現(xiàn)6個(gè)調(diào)控乙烯、ABA、IAA等生長素的基因;3個(gè)鋅結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子(鋅指蛋白);23個(gè)編碼參與不同生物學(xué)代謝途徑的功能酶的候選基因;其余候選基因與編碼逆境脅迫相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子以及跨膜蛋白等相關(guān)。其中,9號(hào)染色體上位于2個(gè)連鎖群體共定位區(qū)間內(nèi)的chr9.S_59587835(P=7.63E-10)對(duì)應(yīng)的GRMZM2G034015;以及在2號(hào)染色體上位于2個(gè)連鎖群體共定位區(qū)間內(nèi)(R2=63.5%,LOD=19.8)的chr2.S_7292809(P=2.03E-08)對(duì)應(yīng)的GRMZM2G042055與位于2號(hào)染色體上關(guān)聯(lián)與連鎖共定位區(qū)間內(nèi)的chr2.S_16948365(P=1.17E-08)對(duì)應(yīng)的GRMZM2G039455,為后續(xù)重點(diǎn)研究的候選基因。3.在銨硝比1:1的供氮條件下,根系產(chǎn)生根系分泌物以抑制生長,pH下降顯著;調(diào)整銨硝比為1:7后,pH環(huán)境得到改善,植株生長正常。當(dāng)BPDS-F(Ⅱ)濃度為0.1μmol L-1時(shí),Wu312被競爭致死,Ye478仍能維持生長。但當(dāng)BPDS-Fe(Ⅱ)水平較高時(shí),新葉脈間仍舊出現(xiàn)不同程度的黃化癥狀,且根系分泌物仍無法徹底消除,說明根系無法與BPDS競爭以獲得充足的鐵元素。與EDTA-Fe(Ⅱ)以及1,10-菲羅啉-Fe(Ⅱ)相比,Ye478地上部與根系生長在2-2'-聯(lián)吡啶-Fe(Ⅱ)供鐵條件下均占優(yōu)勢,不同供鐵條件對(duì)Wu312生物量累積無顯著影響,因此,2-2'-聯(lián)吡啶是構(gòu)建穩(wěn)定持續(xù)Fe(Ⅱ)體系的最優(yōu)螯合劑。4.Chang7-2、KUI3與Ye478缺鐵癥狀并不顯著,表現(xiàn)為耐低鐵自交系;Wu312缺鐵癥狀最為顯著,表現(xiàn)為鐵敏感自交系。葉片SPAD值、株高、地上部與根系干物重、根冠比與相對(duì)根冠比、鐵累積量均是平均玉米耐低鐵脅迫差異的良好指標(biāo)。地上部與根系鐵效率均與鐵轉(zhuǎn)運(yùn)效率顯著相關(guān),而轉(zhuǎn)運(yùn)效率顯著受到地上部對(duì)鐵的需求量的影響。然而,不同玉米自交系鐵效率差異與鐵吸收效率無關(guān),可能與鐵在地上部中的再分配有關(guān)。5.本研究分別利用RIL群體Wu312×Ye478在2個(gè)供鐵水平下,對(duì)耐低鐵脅迫相關(guān)性狀進(jìn)行連鎖分析。結(jié)果顯示,2批試驗(yàn)共定位到50個(gè)QTL,在6條染色體上有9個(gè)不同批次試驗(yàn)共同定位區(qū)間。在全基因組顯著水平下(P3.16E-05),檢測到61個(gè)獨(dú)立位點(diǎn)與耐低鐵性狀顯著關(guān)聯(lián),這61個(gè)顯著關(guān)聯(lián)SNP位點(diǎn)中的14個(gè)位于2批連鎖群體試驗(yàn)的定位區(qū)間內(nèi)。通過對(duì)61個(gè)顯著位點(diǎn)對(duì)應(yīng)的166個(gè)候選基因進(jìn)行功能注釋,發(fā)現(xiàn)約54個(gè)編碼參與不同生物學(xué)代謝途徑的功能酶,除13個(gè)功能未知的基因外,剩余候選基因功能為編碼轉(zhuǎn)錄因子、逆境響應(yīng)因子等。其中,介導(dǎo)甲硫氨酸的生物合成并對(duì)玉米等機(jī)理Ⅱ植物合成植物鐵載體具有關(guān)鍵作用的GRMZM2G113873為后續(xù)功能驗(yàn)證的重要基因。綜上所述,本研究在優(yōu)化營養(yǎng)液供應(yīng)體系的基礎(chǔ)上,結(jié)合連鎖及關(guān)聯(lián)分析,鑒定玉米耐低鋅、鐵脅迫顯著關(guān)聯(lián)的位點(diǎn),挖掘到自然群體中的有利等位基因。并初步剖析了玉米耐低鋅、鐵脅迫的遺傳學(xué)基礎(chǔ),為該復(fù)雜數(shù)量性狀的遺傳解析提供有益信息。
【學(xué)位授予單位】:中國農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:S513

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 印志同;秦秋霞;闞欣;陳雅楠;成前;鄧德祥;;玉米快速葉綠素?zé)晒鈪?shù)全基因組關(guān)聯(lián)分析[J];江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào);2016年04期

2 龍文靖;萬年鑫;辜濤;g,

本文編號(hào):1271000


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