鮸魚DIGIRR基因特征、功能及調(diào)控研究
發(fā)布時(shí)間：2020-12-13 10:22
TLR-IL-1R（Toll-like receptor-interleukin 1 receptor signaling,TIR）超家族成員在介導(dǎo)的先天性免疫反應(yīng)中起著重要作用,其家族成員胞內(nèi)都含有一個(gè)保守的TIR結(jié)構(gòu)域。DIGIRR（Double-Ig-IL-1R Related Molecule）是TIL-IL-1R受體超家族成員之一,作為IL-1信號(hào)通路的負(fù)調(diào)控因子,在免疫系統(tǒng)中發(fā)揮重要作用。在本研究中,我們鑒定并表征了鮸魚（Miichthys miiuy）DIGIRR（mmi-DIGIRR）基因的cDNA序列。mmi-DIGIRR cDNA全長(zhǎng)1837bp,包括211bp的5’UTR、1575bp的開放閱讀框（ORF）,編碼524個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì)和51bp的3’UTR。mmi-DIGIRR的分子量為59.43 KDa,理論等電點(diǎn)為6.16。mmi-DIGIRR具有IL-IR受體家族共同的特征,其蛋白結(jié)構(gòu)域主要由胞內(nèi)保守的TIR結(jié)構(gòu)域和胞外的兩個(gè)免疫蛋白（immunoglobulin,Ig）結(jié)構(gòu)域兩個(gè)部分組成。除此之外,mmi-DIGIRR在胞外區(qū)還有長(zhǎng)16個(gè)氨基酸的信號(hào)肽序列...
【文章來源】：浙江海洋大學(xué)浙江省
【文章頁(yè)數(shù)】：60 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【部分圖文】：
mmi-DIGIRR的基因序列
鮸魚DIGIRR基因特征、功能及調(diào)控研究26圖3-2魚類DIGIRR的基因結(jié)構(gòu)Fig3.2GenomicstructureofDIGIRRinmiiuycroakerandotherfishwhiteboxesrepresentUTR,blackboxesrepresentCDS,intronsarerepresentedbylines.對(duì)于哺乳動(dòng)物SIGIRR基因和魚類DIGIRR基因的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域進(jìn)行比較，如圖3-3，結(jié)果表明，DIGIRR/SIGIRR不僅有TIR家族的特征，也有作為Ig結(jié)構(gòu)域受體亞家族成員的特征。哺乳動(dòng)物SIGIRR基因和魚類DIGIRR基因蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域主要由胞內(nèi)保守的TIR結(jié)構(gòu)域和胞外的Ig結(jié)構(gòu)域組成，但I(xiàn)g結(jié)構(gòu)域的數(shù)量不同，哺乳動(dòng)物SIGIRR基因只含有一個(gè)Ig結(jié)構(gòu)域，魚類DIGIRR基因含有兩個(gè)Ig結(jié)構(gòu)域，此外，魚類DIGIRR基因在N-端還有信號(hào)肽區(qū)域。圖3-3DIGIRR/SIGIRR蛋白結(jié)構(gòu)域Fig3.3ProteindomainofSIGIRR/DIGIRR3.2鮸魚DIGIRR基因的線性分析和系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建我們利用魚類基因組數(shù)據(jù)對(duì)鮸魚DIGIRR、其他魚類SIGIRR/DIGIRR與哺乳動(dòng)物和鳥類的SIGIRR進(jìn)行線性分析，結(jié)果見圖3-4。DIGIRR基因在不同物種中的線性分析進(jìn)一步證實(shí)了DIGIRR基因的位置。從結(jié)果可以看出，DIGIRR/SIGIRR基因線性關(guān)
鮸魚DIGIRR基因特征、功能及調(diào)控研究26圖3-2魚類DIGIRR的基因結(jié)構(gòu)Fig3.2GenomicstructureofDIGIRRinmiiuycroakerandotherfishwhiteboxesrepresentUTR,blackboxesrepresentCDS,intronsarerepresentedbylines.對(duì)于哺乳動(dòng)物SIGIRR基因和魚類DIGIRR基因的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域進(jìn)行比較，如圖3-3，結(jié)果表明，DIGIRR/SIGIRR不僅有TIR家族的特征，也有作為Ig結(jié)構(gòu)域受體亞家族成員的特征。哺乳動(dòng)物SIGIRR基因和魚類DIGIRR基因蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域主要由胞內(nèi)保守的TIR結(jié)構(gòu)域和胞外的Ig結(jié)構(gòu)域組成，但I(xiàn)g結(jié)構(gòu)域的數(shù)量不同，哺乳動(dòng)物SIGIRR基因只含有一個(gè)Ig結(jié)構(gòu)域，魚類DIGIRR基因含有兩個(gè)Ig結(jié)構(gòu)域，此外，魚類DIGIRR基因在N-端還有信號(hào)肽區(qū)域。圖3-3DIGIRR/SIGIRR蛋白結(jié)構(gòu)域Fig3.3ProteindomainofSIGIRR/DIGIRR3.2鮸魚DIGIRR基因的線性分析和系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建我們利用魚類基因組數(shù)據(jù)對(duì)鮸魚DIGIRR、其他魚類SIGIRR/DIGIRR與哺乳動(dòng)物和鳥類的SIGIRR進(jìn)行線性分析，結(jié)果見圖3-4。DIGIRR基因在不同物種中的線性分析進(jìn)一步證實(shí)了DIGIRR基因的位置。從結(jié)果可以看出，DIGIRR/SIGIRR基因線性關(guān)
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]IL1R2在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的作用[J]. 劉穎婷,盧斌峰,蔣敬庭. 中國(guó)腫瘤生物治療雜志. 2018(08)
[2]魚類免疫系統(tǒng)的研究進(jìn)展[J]. 張媛媛,宋理平. 河北漁業(yè). 2018(02)
[3]魚類免疫應(yīng)答機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 白姍姍,賈智英,石連玉. 水產(chǎn)學(xué)雜志. 2017(04)
[4]魚類免疫系統(tǒng)的研究進(jìn)展[J]. 王俊相,李玉萍,孔令富,李蓮軍. 四川畜牧獸醫(yī). 2010(07)
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[6]調(diào)節(jié)IL-1受體轉(zhuǎn)位至焦點(diǎn)附著斑的觀察[J]. 黃文燕,朱文淵,羅秀梅,許孟杰,Eva E QWARNSTROM. 免疫學(xué)雜志. 2004(01)
[7]魚類免疫系統(tǒng)的研究進(jìn)展[J]. 孫德文,詹勇,許梓榮. 水利漁業(yè). 2002(06)
[8]I型IL-1受體的結(jié)構(gòu)與其轉(zhuǎn)運(yùn)功能相關(guān)的研究[J]. 黃文燕,羅兆明,David Wyllie,Eva E.Qwarnstrom. 中國(guó)病理生理雜志. 2001(02)
[9]一個(gè)新的信號(hào)受體家族——Toll/IL1R家族的研究進(jìn)展[J]. 陳建,羅向東,楊宗城,張宗梁. 生理科學(xué)進(jìn)展. 2000(04)
[10]魚類體液免疫因子研究進(jìn)展[J]. 張永安,聶品. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2000(04)
博士論文
[1]魚類IL-1R及相關(guān)家族成員的分子克隆與功能研究[D]. 顧一峰.浙江大學(xué) 2011
碩士論文
[1]魚類TLR1和DIGIRR基因的克隆和表達(dá)研究[D]. 武小媛.浙江大學(xué) 2007
[2]IL-1RI、IL-1RII、IL-1RAcP在骨性關(guān)節(jié)炎滑膜中的表達(dá)及其生物學(xué)意義[D]. 張青松.華中科技大學(xué) 2006
本文編號(hào)：2914392
【文章來源】：浙江海洋大學(xué)浙江省
【文章頁(yè)數(shù)】：60 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【部分圖文】：
mmi-DIGIRR的基因序列
鮸魚DIGIRR基因特征、功能及調(diào)控研究26圖3-2魚類DIGIRR的基因結(jié)構(gòu)Fig3.2GenomicstructureofDIGIRRinmiiuycroakerandotherfishwhiteboxesrepresentUTR,blackboxesrepresentCDS,intronsarerepresentedbylines.對(duì)于哺乳動(dòng)物SIGIRR基因和魚類DIGIRR基因的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域進(jìn)行比較，如圖3-3，結(jié)果表明，DIGIRR/SIGIRR不僅有TIR家族的特征，也有作為Ig結(jié)構(gòu)域受體亞家族成員的特征。哺乳動(dòng)物SIGIRR基因和魚類DIGIRR基因蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域主要由胞內(nèi)保守的TIR結(jié)構(gòu)域和胞外的Ig結(jié)構(gòu)域組成，但I(xiàn)g結(jié)構(gòu)域的數(shù)量不同，哺乳動(dòng)物SIGIRR基因只含有一個(gè)Ig結(jié)構(gòu)域，魚類DIGIRR基因含有兩個(gè)Ig結(jié)構(gòu)域，此外，魚類DIGIRR基因在N-端還有信號(hào)肽區(qū)域。圖3-3DIGIRR/SIGIRR蛋白結(jié)構(gòu)域Fig3.3ProteindomainofSIGIRR/DIGIRR3.2鮸魚DIGIRR基因的線性分析和系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建我們利用魚類基因組數(shù)據(jù)對(duì)鮸魚DIGIRR、其他魚類SIGIRR/DIGIRR與哺乳動(dòng)物和鳥類的SIGIRR進(jìn)行線性分析，結(jié)果見圖3-4。DIGIRR基因在不同物種中的線性分析進(jìn)一步證實(shí)了DIGIRR基因的位置。從結(jié)果可以看出，DIGIRR/SIGIRR基因線性關(guān)
鮸魚DIGIRR基因特征、功能及調(diào)控研究26圖3-2魚類DIGIRR的基因結(jié)構(gòu)Fig3.2GenomicstructureofDIGIRRinmiiuycroakerandotherfishwhiteboxesrepresentUTR,blackboxesrepresentCDS,intronsarerepresentedbylines.對(duì)于哺乳動(dòng)物SIGIRR基因和魚類DIGIRR基因的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域進(jìn)行比較，如圖3-3，結(jié)果表明，DIGIRR/SIGIRR不僅有TIR家族的特征，也有作為Ig結(jié)構(gòu)域受體亞家族成員的特征。哺乳動(dòng)物SIGIRR基因和魚類DIGIRR基因蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域主要由胞內(nèi)保守的TIR結(jié)構(gòu)域和胞外的Ig結(jié)構(gòu)域組成，但I(xiàn)g結(jié)構(gòu)域的數(shù)量不同，哺乳動(dòng)物SIGIRR基因只含有一個(gè)Ig結(jié)構(gòu)域，魚類DIGIRR基因含有兩個(gè)Ig結(jié)構(gòu)域，此外，魚類DIGIRR基因在N-端還有信號(hào)肽區(qū)域。圖3-3DIGIRR/SIGIRR蛋白結(jié)構(gòu)域Fig3.3ProteindomainofSIGIRR/DIGIRR3.2鮸魚DIGIRR基因的線性分析和系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建我們利用魚類基因組數(shù)據(jù)對(duì)鮸魚DIGIRR、其他魚類SIGIRR/DIGIRR與哺乳動(dòng)物和鳥類的SIGIRR進(jìn)行線性分析，結(jié)果見圖3-4。DIGIRR基因在不同物種中的線性分析進(jìn)一步證實(shí)了DIGIRR基因的位置。從結(jié)果可以看出，DIGIRR/SIGIRR基因線性關(guān)
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[8]I型IL-1受體的結(jié)構(gòu)與其轉(zhuǎn)運(yùn)功能相關(guān)的研究[J]. 黃文燕,羅兆明,David Wyllie,Eva E.Qwarnstrom. 中國(guó)病理生理雜志. 2001(02)
[9]一個(gè)新的信號(hào)受體家族——Toll/IL1R家族的研究進(jìn)展[J]. 陳建,羅向東,楊宗城,張宗梁. 生理科學(xué)進(jìn)展. 2000(04)
[10]魚類體液免疫因子研究進(jìn)展[J]. 張永安,聶品. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2000(04)
博士論文
[1]魚類IL-1R及相關(guān)家族成員的分子克隆與功能研究[D]. 顧一峰.浙江大學(xué) 2011
碩士論文
[1]魚類TLR1和DIGIRR基因的克隆和表達(dá)研究[D]. 武小媛.浙江大學(xué) 2007
[2]IL-1RI、IL-1RII、IL-1RAcP在骨性關(guān)節(jié)炎滑膜中的表達(dá)及其生物學(xué)意義[D]. 張青松.華中科技大學(xué) 2006
本文編號(hào)：2914392
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