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鮸魚DIGIRR基因特征、功能及調(diào)控研究

發(fā)布時(shí)間:2020-12-13 10:22
  TLR-IL-1R(Toll-like receptor-interleukin 1 receptor signaling,TIR)超家族成員在介導(dǎo)的先天性免疫反應(yīng)中起著重要作用,其家族成員胞內(nèi)都含有一個(gè)保守的TIR結(jié)構(gòu)域。DIGIRR(Double-Ig-IL-1R Related Molecule)是TIL-IL-1R受體超家族成員之一,作為IL-1信號通路的負(fù)調(diào)控因子,在免疫系統(tǒng)中發(fā)揮重要作用。在本研究中,我們鑒定并表征了鮸魚(Miichthys miiuy)DIGIRR(mmi-DIGIRR)基因的cDNA序列。mmi-DIGIRR cDNA全長1837bp,包括211bp的5’UTR、1575bp的開放閱讀框(ORF),編碼524個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì)和51bp的3’UTR。mmi-DIGIRR的分子量為59.43 KDa,理論等電點(diǎn)為6.16。mmi-DIGIRR具有IL-IR受體家族共同的特征,其蛋白結(jié)構(gòu)域主要由胞內(nèi)保守的TIR結(jié)構(gòu)域和胞外的兩個(gè)免疫蛋白(immunoglobulin,Ig)結(jié)構(gòu)域兩個(gè)部分組成。除此之外,mmi-DIGIRR在胞外區(qū)還有長16個(gè)氨基酸的信號肽序列... 

【文章來源】:浙江海洋大學(xué)浙江省

【文章頁數(shù)】:60 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

鮸魚DIGIRR基因特征、功能及調(diào)控研究


mmi-DIGIRR的基因序列

魚類,基因,結(jié)構(gòu)域


鮸魚DIGIRR基因特征、功能及調(diào)控研究26圖3-2魚類DIGIRR的基因結(jié)構(gòu)Fig3.2GenomicstructureofDIGIRRinmiiuycroakerandotherfishwhiteboxesrepresentUTR,blackboxesrepresentCDS,intronsarerepresentedbylines.對于哺乳動(dòng)物SIGIRR基因和魚類DIGIRR基因的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域進(jìn)行比較,如圖3-3,結(jié)果表明,DIGIRR/SIGIRR不僅有TIR家族的特征,也有作為Ig結(jié)構(gòu)域受體亞家族成員的特征。哺乳動(dòng)物SIGIRR基因和魚類DIGIRR基因蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域主要由胞內(nèi)保守的TIR結(jié)構(gòu)域和胞外的Ig結(jié)構(gòu)域組成,但I(xiàn)g結(jié)構(gòu)域的數(shù)量不同,哺乳動(dòng)物SIGIRR基因只含有一個(gè)Ig結(jié)構(gòu)域,魚類DIGIRR基因含有兩個(gè)Ig結(jié)構(gòu)域,此外,魚類DIGIRR基因在N-端還有信號肽區(qū)域。圖3-3DIGIRR/SIGIRR蛋白結(jié)構(gòu)域Fig3.3ProteindomainofSIGIRR/DIGIRR3.2鮸魚DIGIRR基因的線性分析和系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建我們利用魚類基因組數(shù)據(jù)對鮸魚DIGIRR、其他魚類SIGIRR/DIGIRR與哺乳動(dòng)物和鳥類的SIGIRR進(jìn)行線性分析,結(jié)果見圖3-4。DIGIRR基因在不同物種中的線性分析進(jìn)一步證實(shí)了DIGIRR基因的位置。從結(jié)果可以看出,DIGIRR/SIGIRR基因線性關(guān)

結(jié)構(gòu)域,蛋白,基因,魚類


鮸魚DIGIRR基因特征、功能及調(diào)控研究26圖3-2魚類DIGIRR的基因結(jié)構(gòu)Fig3.2GenomicstructureofDIGIRRinmiiuycroakerandotherfishwhiteboxesrepresentUTR,blackboxesrepresentCDS,intronsarerepresentedbylines.對于哺乳動(dòng)物SIGIRR基因和魚類DIGIRR基因的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域進(jìn)行比較,如圖3-3,結(jié)果表明,DIGIRR/SIGIRR不僅有TIR家族的特征,也有作為Ig結(jié)構(gòu)域受體亞家族成員的特征。哺乳動(dòng)物SIGIRR基因和魚類DIGIRR基因蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域主要由胞內(nèi)保守的TIR結(jié)構(gòu)域和胞外的Ig結(jié)構(gòu)域組成,但I(xiàn)g結(jié)構(gòu)域的數(shù)量不同,哺乳動(dòng)物SIGIRR基因只含有一個(gè)Ig結(jié)構(gòu)域,魚類DIGIRR基因含有兩個(gè)Ig結(jié)構(gòu)域,此外,魚類DIGIRR基因在N-端還有信號肽區(qū)域。圖3-3DIGIRR/SIGIRR蛋白結(jié)構(gòu)域Fig3.3ProteindomainofSIGIRR/DIGIRR3.2鮸魚DIGIRR基因的線性分析和系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建我們利用魚類基因組數(shù)據(jù)對鮸魚DIGIRR、其他魚類SIGIRR/DIGIRR與哺乳動(dòng)物和鳥類的SIGIRR進(jìn)行線性分析,結(jié)果見圖3-4。DIGIRR基因在不同物種中的線性分析進(jìn)一步證實(shí)了DIGIRR基因的位置。從結(jié)果可以看出,DIGIRR/SIGIRR基因線性關(guān)

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]IL1R2在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的作用[J]. 劉穎婷,盧斌峰,蔣敬庭.  中國腫瘤生物治療雜志. 2018(08)
[2]魚類免疫系統(tǒng)的研究進(jìn)展[J]. 張媛媛,宋理平.  河北漁業(yè). 2018(02)
[3]魚類免疫應(yīng)答機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 白姍姍,賈智英,石連玉.  水產(chǎn)學(xué)雜志. 2017(04)
[4]魚類免疫系統(tǒng)的研究進(jìn)展[J]. 王俊相,李玉萍,孔令富,李蓮軍.  四川畜牧獸醫(yī). 2010(07)
[5]魚類髓樣分化因子88(MyD88)的研究進(jìn)展[J]. 鄭琳琳,張圣強(qiáng),安利國.  科技信息. 2009(34)
[6]調(diào)節(jié)IL-1受體轉(zhuǎn)位至焦點(diǎn)附著斑的觀察[J]. 黃文燕,朱文淵,羅秀梅,許孟杰,Eva E QWARNSTROM.  免疫學(xué)雜志. 2004(01)
[7]魚類免疫系統(tǒng)的研究進(jìn)展[J]. 孫德文,詹勇,許梓榮.  水利漁業(yè). 2002(06)
[8]I型IL-1受體的結(jié)構(gòu)與其轉(zhuǎn)運(yùn)功能相關(guān)的研究[J]. 黃文燕,羅兆明,David Wyllie,Eva E.Qwarnstrom.  中國病理生理雜志. 2001(02)
[9]一個(gè)新的信號受體家族——Toll/IL1R家族的研究進(jìn)展[J]. 陳建,羅向東,楊宗城,張宗梁.  生理科學(xué)進(jìn)展. 2000(04)
[10]魚類體液免疫因子研究進(jìn)展[J]. 張永安,聶品.  水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2000(04)

博士論文
[1]魚類IL-1R及相關(guān)家族成員的分子克隆與功能研究[D]. 顧一峰.浙江大學(xué) 2011

碩士論文
[1]魚類TLR1和DIGIRR基因的克隆和表達(dá)研究[D]. 武小媛.浙江大學(xué) 2007
[2]IL-1RI、IL-1RII、IL-1RAcP在骨性關(guān)節(jié)炎滑膜中的表達(dá)及其生物學(xué)意義[D]. 張青松.華中科技大學(xué) 2006



本文編號:2914392

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