刺參生殖相關(guān)神經(jīng)肽挖掘及特征研究
發(fā)布時(shí)間:2020-12-19 19:19
本論文以刺參生殖發(fā)育相關(guān)神經(jīng)肽的功能基因篩選及活性研究為核心,通過生物信息學(xué)分析、分子克隆、細(xì)胞水平的活性驗(yàn)證及生理功能評(píng)價(jià),開展較為系統(tǒng)的研究探索,以期為刺參生殖發(fā)育的神經(jīng)內(nèi)分泌調(diào)控研究奠定基礎(chǔ)。具體基于刺參基因組、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)篩選到4條刺參生殖發(fā)育相關(guān)神經(jīng)肽編碼基因,并重點(diǎn)圍繞刺參Kisspeptin神經(jīng)肽,初步闡明了分子結(jié)構(gòu)、活性特征及生理功能。主要研究成果如下:1、篩選獲得4條刺參生殖調(diào)控相關(guān)的神經(jīng)肽樣蛋白編碼基因序列(AjKisspeptin、NPS/CCAP型肽(NG)、F-likeSALMF(FS)、L-likeSALMF(LS))。其中刺參kisspepetin前體肽ORF區(qū)長543bp,預(yù)測編碼180個(gè)氨基酸長度的前體肽,包含長23aa信號(hào)肽、兩段長度分別為32aa(AjKiss1a(AGSLDcEDVERRGRQPNRNAHYRTLPF-NH2))和18aa(AjKiss1b(SAVKNKNKSRARPPLLPF-NH2))的成熟肽。預(yù)測其前體肽的等電點(diǎn)(pI)為4.90,分子量(Mw)為20.283 kD。通過熒光定量基因...
【文章來源】:浙江海洋大學(xué)浙江省
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
以HPG軸為核心的生殖調(diào)控網(wǎng)絡(luò)模型
技術(shù)路線
刺參生殖相關(guān)神經(jīng)肽發(fā)掘及功能研究16圖2.1AjKisspeptin前體肽編碼基因的編碼區(qū)及預(yù)測的氨基酸序列。藍(lán)色表示信號(hào)肽,方框表示起始密碼子,星號(hào)表示終止密碼子,綠色方框表示預(yù)測到的切割位點(diǎn),紅色方框表示成熟肽,黃色方框表示切割后殘留的C端甘氨酸殘基Fig2.1TheCDSandpredictedaminoacidsequenceoftheAjKisspeptinprecursorgene.Blueindicatessignalpeptide,boxindicatesstartcodon,asteriskindicatesstopcodon,greenboxindicatespredictedcleavagesite,redboxindicatesmaturepeptide,yellowboxindicatesC-terminalglycineremainingaftercleavageResidues2.3.1.2氨基酸同源性和系統(tǒng)發(fā)育分析為了探究新發(fā)的AjKisspeptin與其它物種Kisspeptin的近緣關(guān)系,從NCBI數(shù)據(jù)庫中篩選到8條不同物種的Kisspeptin氨基酸序列(負(fù)鼠(Monodelphisdomestic)、智人(Homosapines)、非洲爪蟾(Xenopuslaevis)、石斑魚(Epinehelusbruneus)、金魚(Carassiusauratus)、斑馬魚(Daniorerio)、海星(Ophionotunvictorae))用MEGA5.0軟件,以最大似然法(ML),重復(fù)1000次,構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖2.2)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),Kisspeptin在進(jìn)化中明顯的分為兩支,一支是脊椎動(dòng)物分支,另一支為無脊椎動(dòng)物分支,恰好與這些動(dòng)物類群的分類階元和進(jìn)化地位相一致。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]刺參GPR54-like受體基因克隆及特征分析[J]. 于秋寒,平洪領(lǐng),閆允君,史會(huì)來,呂振明,楊靜文. 海洋科學(xué). 2018(03)
[2]肽類激素Kisspeptin在生殖內(nèi)分泌領(lǐng)域的應(yīng)用前景[J]. 傅燕玲,朱依敏. 浙江大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2017(03)
[3]蛋白質(zhì)N末端組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 王志強(qiáng),張瑤,洪學(xué)傳,徐平. 生物工程學(xué)報(bào). 2016(08)
[4]Kisspeptin調(diào)控魚類生殖內(nèi)分泌的研究進(jìn)展[J]. 卓琦. 動(dòng)物學(xué)研究. 2013(05)
[5]刺參健康養(yǎng)殖中的防病措施[J]. 楊秀生,王淑嫻,樊英,許拉,蓋春蕾. 河北漁業(yè). 2009(09)
[6]海參的營養(yǎng)成分介紹[J]. 李春艷,常亞青. 科學(xué)養(yǎng)魚. 2006(02)
本文編號(hào):2926435
【文章來源】:浙江海洋大學(xué)浙江省
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
以HPG軸為核心的生殖調(diào)控網(wǎng)絡(luò)模型
技術(shù)路線
刺參生殖相關(guān)神經(jīng)肽發(fā)掘及功能研究16圖2.1AjKisspeptin前體肽編碼基因的編碼區(qū)及預(yù)測的氨基酸序列。藍(lán)色表示信號(hào)肽,方框表示起始密碼子,星號(hào)表示終止密碼子,綠色方框表示預(yù)測到的切割位點(diǎn),紅色方框表示成熟肽,黃色方框表示切割后殘留的C端甘氨酸殘基Fig2.1TheCDSandpredictedaminoacidsequenceoftheAjKisspeptinprecursorgene.Blueindicatessignalpeptide,boxindicatesstartcodon,asteriskindicatesstopcodon,greenboxindicatespredictedcleavagesite,redboxindicatesmaturepeptide,yellowboxindicatesC-terminalglycineremainingaftercleavageResidues2.3.1.2氨基酸同源性和系統(tǒng)發(fā)育分析為了探究新發(fā)的AjKisspeptin與其它物種Kisspeptin的近緣關(guān)系,從NCBI數(shù)據(jù)庫中篩選到8條不同物種的Kisspeptin氨基酸序列(負(fù)鼠(Monodelphisdomestic)、智人(Homosapines)、非洲爪蟾(Xenopuslaevis)、石斑魚(Epinehelusbruneus)、金魚(Carassiusauratus)、斑馬魚(Daniorerio)、海星(Ophionotunvictorae))用MEGA5.0軟件,以最大似然法(ML),重復(fù)1000次,構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖2.2)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),Kisspeptin在進(jìn)化中明顯的分為兩支,一支是脊椎動(dòng)物分支,另一支為無脊椎動(dòng)物分支,恰好與這些動(dòng)物類群的分類階元和進(jìn)化地位相一致。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]刺參GPR54-like受體基因克隆及特征分析[J]. 于秋寒,平洪領(lǐng),閆允君,史會(huì)來,呂振明,楊靜文. 海洋科學(xué). 2018(03)
[2]肽類激素Kisspeptin在生殖內(nèi)分泌領(lǐng)域的應(yīng)用前景[J]. 傅燕玲,朱依敏. 浙江大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2017(03)
[3]蛋白質(zhì)N末端組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 王志強(qiáng),張瑤,洪學(xué)傳,徐平. 生物工程學(xué)報(bào). 2016(08)
[4]Kisspeptin調(diào)控魚類生殖內(nèi)分泌的研究進(jìn)展[J]. 卓琦. 動(dòng)物學(xué)研究. 2013(05)
[5]刺參健康養(yǎng)殖中的防病措施[J]. 楊秀生,王淑嫻,樊英,許拉,蓋春蕾. 河北漁業(yè). 2009(09)
[6]海參的營養(yǎng)成分介紹[J]. 李春艷,常亞青. 科學(xué)養(yǎng)魚. 2006(02)
本文編號(hào):2926435
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