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中國流行的兩個進化分支C4亞型EV71病毒3D蛋白氨基酸變異分析

發(fā)布時間:2020-12-11 11:15
  目的分析不同進化分支腸道病毒71型(EV71)的3D蛋白氨基酸序列的差異,了解潛在毒力相關(guān)變異位點。方法從GenBank和實驗室收集C4基因亞型EV71全基因序列,以VP1序列做進化分析,統(tǒng)計分析C4a和C4b兩進化分支EV71病毒的3D蛋白氨基酸序列。結(jié)果共收集病毒序列301株C4型EV71毒株,其中C4a序列293株、C4b序列8株。不同進化分支中3D區(qū)有22個氨基酸殘基分布有統(tǒng)計學(xué)意義。結(jié)論兩種進化分支C4亞型EV71病毒的3D蛋白,共有22個位點氨基酸變異,其生物學(xué)意義有待進一步研究。 

【文章來源】:海峽預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2019年03期 第1-3頁

【文章頁數(shù)】:3 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 材料來源
    1.2 病毒基因型/亞型判定
    1.3 病毒氨基酸序列分析
2 結(jié)果
    2.1 基于VP1序列的種系進化分析
    2.2 病毒3D蛋白氨基酸序列比較分析
3 討論


【參考文獻】:
期刊論文
[1]腸道病毒71型非編碼區(qū)結(jié)構(gòu)與功能研究進展[J]. 董禎,溫紅玲.  中華實驗和臨床病毒學(xué)雜志. 2018 (05)
[2]昆明市EV71病毒分離株3D蛋白酶序列特征、病毒增殖特性分析[J]. 鄭惠文,孫明,范海濤,寧若彤,李嘉祺,李洪哲,楊哲寧,劉龍丁,施海晶.  中國病原生物學(xué)雜志. 2017(08)
[3]廣西壯族自治區(qū)2001年急性弛緩性麻痹病例中2株C4b亞型進化分支人腸道病毒71型VP1編碼區(qū)基因特征分析[J]. 鄧麗麗,劉巍,謝鎮(zhèn)國,班華國,譚冬梅,韋一知,馬宇燕,卓家同.  中國疫苗和免疫. 2012(06)
[4]EV71毒力相關(guān)位點研究進展[J]. 趙鋼,施海晶.  國際病毒學(xué)雜志. 2012 (06)



本文編號:2910433

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