陸川豬MC1R和KIT基因型鑒定
本文選題:陸川豬 切入點:毛色 出處:《中國畜牧獸醫(yī)》2017年03期 論文類型:期刊論文
【摘要】:為了檢測陸川豬種群的純度,本研究以4個華南地方豬種(莆田黑豬、粵東黑豬、大花白豬、巴馬香豬)和3個外來豬種(杜洛克豬、大白豬、長白豬)作為對照,利用PCR測序法對陸川豬群體56個樣本的MC1R和KIT基因進(jìn)行基因型鑒定。測序結(jié)果表明,大白豬和長白豬KIT基因內(nèi)含子17的第1個堿基發(fā)生GA剪接突變,而陸川豬和4個華南地方豬種,以及杜洛克豬中KIT基因型一樣,均為野生型的GG基因型;MC1R基因編碼區(qū)分析表明,以海南野豬MC1R基因型作為參考序列,陸川豬和4個華南地方豬種在MC1R基因編碼區(qū)存在95ValMet和102LeuPro兩個錯義突變;MC1R基因非編碼區(qū)分析表明,與大白豬、長白豬和杜洛克豬相比,陸川豬和4個華南地方豬種MC1R基因的5′UTR分別存在5~6個SNPs,3′UTR存在1個A堿基的缺失。另外,試驗對一窩毛色異常的陸川豬仔豬及其親本的KIT和MC1R基因進(jìn)行測序分析,結(jié)果表明,仔豬及其親本的KIT基因型均為GG野生型,仔豬和母本的MC1R基因均存在ED1和Ep兩種不同的基因型,父本的MC1R基因型為ED1,因Ep對應(yīng)于皮特蘭豬的斑塊表型,所以初步判定母本滲入了外來豬種的血統(tǒng)。本研究通過檢測陸川豬等8個豬種的毛色相關(guān)基因KIT和MC1R基因的基因型,證實了中外豬種間在毛色遺傳上的分子差異,為今后深入研究豬毛色遺傳的分子調(diào)控機理提供參考。
[Abstract]:In order to test the purity of Luchuan pig population, four South China local pig breeds (Putian black pig, eastern Guangdong black pig, big flower white pig, Bama Xiang pig) and three foreign pig breeds (Duroc, big white, Landrace) were used as control. The genotypes of MC1R and KIT genes in 56 samples of Luchuan pig population were identified by PCR sequencing. The results showed that GA splicing mutation occurred in the first base of intron 17 of KIT gene in large white pig and Landrace pig. However, the KIT genotypes of Luchuan pig, four local South China pigs and Duroc pigs were all wild type GG genotypes and MC-1R gene coding region analysis showed that the MC1R genotype of Hainan wild boar was taken as the reference sequence. The analysis of 95 ValMet and 102 LeuPro missense mutations of MC1R gene in the coding region of MC1R gene in Luchuan pig and four local swine breeds in South China showed that compared with large white pig, Landrace pig and Duroc pig, there were two missense mutants in Luchuan pig, Landrace pig and Duroc pig. In Luchuan pig and 4 local swine breeds in South China, 5 ~ 6 SNPs 3 MC1R genes were found in 5 ~ 6 MC1R genes. In addition, the KIT and MC1R genes of a litter of piglets with abnormal coat color were sequenced and analyzed. The KIT genotypes of piglets and their parents were all GG wild type. The MC1R gene of both piglets and mothers had two different genotypes, ED1 and EP. The MC1R genotype of male parent was ED1, because EP corresponded to the patch phenotype of Pieterland pig. Therefore, it was preliminarily determined that the female parent infiltrated into the lineage of foreign pig breeds. By detecting the genotypes of KIT and MC1R genes related to coat color in eight pig breeds, including Luchuan pigs, this study confirmed the molecular differences in coat color inheritance between Chinese and foreign pig breeds. It provides a reference for further study on molecular regulation mechanism of pig coat color inheritance.
【作者單位】: 中山大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院有害生物控制與資源利用國家重點實驗室;廣東壹號食品股份有限公司;
【基金】:科技基礎(chǔ)性工作專項(2014FY120800) 廣東省省級科技計劃(2014B020202001) 廣東省揚帆計劃(2014YT02H042) 廣東省自然科學(xué)基金(2016A030313310) 國家轉(zhuǎn)基因生物新品種培育重大專項(2016ZX08006003-006)
【分類號】:S828
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2 許鐘\,
本文編號:1590033
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