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基于微陣列數(shù)據(jù)探討金屬硫蛋白在吸煙者氣道的變化及其可能機(jī)制

發(fā)布時(shí)間:2024-07-02 20:38
  目的探討吸煙對(duì)氣道金屬硫蛋白(MT)表達(dá)的影響及其可能機(jī)制。方法獲取公共基因表達(dá)綜合數(shù)據(jù)庫(kù)(GEO)的微陣列矩陣數(shù)據(jù)并進(jìn)行整合分析,以確定煙霧暴露后MT表達(dá)的變化趨勢(shì);同時(shí)使用mi RDB數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)靶向16個(gè)MT的mi RNA,CLUSTAL W軟件對(duì)MT m RNA進(jìn)行多序列比對(duì)。結(jié)果急性吸煙刺激氣道MT表達(dá),慢性吸煙抑制氣道MT表達(dá)。慢性吸煙者氣道MT1、MT2、MT3表達(dá)與吸煙指數(shù)呈顯著負(fù)相關(guān),但其不影響MT4表達(dá)。MT1、MT2、MT3 m RNA序列包含"CTCCTGC"片段,可與hsa-mi R-4722-5p種子區(qū)域匹配,而MT4 m RNA序列缺乏結(jié)合位點(diǎn)。結(jié)論 MT1、MT2、MT3和hsa-mi R-4722-5p可能是減輕吸煙損傷和預(yù)防慢性阻塞性肺疾病(COPD)進(jìn)展的潛在靶點(diǎn)。

【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)

【文章目錄】:
1 資料和方法
    1.1 矩陣GSE97010和GSE14383數(shù)據(jù)處理[9]
    1.2 整合分析
        1.2.1 獲取和篩選微陣列數(shù)據(jù)
        1.2.2 探針過(guò)濾和基因映射
        1.2.3 組內(nèi)相關(guān)系數(shù)(ICC)
        1.2.4 統(tǒng)計(jì)分析
    1.3 建立線性回歸模型
    1.4 miRNA預(yù)測(cè)[10-11]
2 結(jié)果
    2.1 急性煙霧暴露和CSC對(duì)MT的影響
    2.2 長(zhǎng)期煙霧暴露對(duì)氣道MT1、MT2和MT3表達(dá)的影響
    2.3 吸煙指數(shù)對(duì)氣道MT1、MT2和MT3的影響
    2.4 hsa-miR-4722-5p對(duì)長(zhǎng)期煙霧暴露氣道MT1、MT2、MT3的影響
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